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BIBLIOTECA DO INSTITUTO DE QUÍMICA
UNICAMP

 
DISSERTAÇÃO DE MESTRADO
 
Autor: Cirino, José Jair Vianna
Título: Cálculos de Potenciais de Ionização de Algumas Bases Purinas e Aza-Análogas Utilizando o Método Semi-Empírico HAM/3
Ano: 1994
Orientador: Prof. Dr. Yuji Takahata
Departamento: Físico-Química
Palavras-chave: --
Resumo: Inicialmente procedeu-se a otimização de geometrias das bases purinas guanina, 8-azaguanjna, xantina, 8-azaxantina e hipoxantina com o uso dos métodos semi-empíricos MNDO, AMI e MNDO-PM3. Nesta etapa também fez-se uso de métodos ab initio utilizando o conjunto de base cep-31G. Os potenciais de ionização dos elétrons do caroço das bases purinas foram calculados posteriormente por meio do método semi-empírico HAM/3 empregando as geometrias otimizadas pelos métodos semi-empíricos na etapa anterior. Cálculos ab initio destes potenciais de ionização também foram realizados empregando os conjuntos de base 4-31G, 6-31G e D95 com aplicação do teorema de Koopmans. Calcularam-se as distribuições de cargas nestas moléculas com os métodos semi-empíricos HAM/3 e AM1, e ab initio (4-31G, 6-31G e D95) e fizeram-se comparações entre estes cálculos. Investigou-se a relação entre deslocamentos químicos dos potenciais de ionização dos elétrons do caroço e cargas atômicas líquidas. Calcularam-se os potenciais de ionização dos elétrons de valência das moléculas guanina, xantina e hipoxantina por meio dos métodos HAM/3 e ab initio com os conjuntos de base 4-31G, 6-31G e D95. Diagramas de energia orbital foram construídos com base nestes cálculos para comparação entre os métodos. Também foram elaboradas representações esquemáticas de alguns orbitais moleculares destas três moléculas com o emprego do pacote PSI/88 e das funções de onda geradas pelos métodos AM1 e ab initio com a base 6-31G. Atribuiram-se os espectros de fotoelétrons destas moléculas com base nos cálculos acima realizados.
Abstract: Initially we optimized geometries of the purine bases; guanine, xanthine, hipoxanthine, and the aza-analogous 8-azaguanine, and 8-azaxanthine with semiempirical MNDO, AM1, and MNDO- PM3 methods. We also used ab initio methods using cep-31G basis set. Core-electron binding energies for these molecules were calculated by means of semiempirical HAM/3 method. We used the geometries optimized with the semiempirical methods in the first step. We also calculated core-electron binding energies with ab initio methods employing 4-31G, 6-31G, and D95 basis set where the Koopmans' theorem was used. Charge distributions were calculated in the same way and the two methods were compared each other. The relation between chemical shifts and net atomic charges was investigated. Ionization potentials of the valence shell of guanine, xanthine, and hipoxanthine were calculated by HAM/3 and ab initio (4-31G, 6-31G, and D95) methods. Some energy diagrams were constructed for these molecules in arder to compare the two methods. Some illustrative representations of the molecular orbitals of these molecules were generated by PSI/88 program using ab initio 6-31G and AM1 calculation results. The photoelectron spectra of these molecules were assigned based on the calculations done above.
Arquivo (Texto Completo): vtls000080066.pdf ( tamanho: 4,18MB )

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